Obstaja več vrst mikroskopov:
1. Svetlobni mikroskop (optični mikroskop): To je najpogostejša vrsta mikroskopa, ki uporablja vidno svetlobo za povečavo predmetov. Ima različne modele, vključno s sestavljenimi mikroskopi, stereo mikroskopi in digitalnimi mikroskopi.
2. Elektronski mikroskop: Ti mikroskopi uporabljajo žarek elektronov namesto svetlobe, da ustvarijo povečano sliko. Obstajata dve glavni vrsti: transmisijski elektronski mikroskop (TEM) in vrstični elektronski mikroskop (SEM).
3. Fluorescenčni mikroskop: Ta vrsta mikroskopa uporablja fluorescenco za vizualizacijo določenih delov vzorca. Pogosto se uporablja v biologiji in medicinskih raziskavah.
4. Konfokalni mikroskop: Ta mikroskop uporablja lasersko skeniranje za ustvarjanje zelo podrobnih slik. Običajno se uporablja v bioloških raziskavah in medicinskem slikanju.
5. Mikroskop s faznim kontrastom: Ta mikroskop poveča kontrast prozornih in neobarvanih vzorcev, zaradi česar so vidni in lažji za preučevanje.
6. Polarizacijski mikroskop: Ta mikroskop se uporablja za preučevanje optičnih lastnosti kristalov in drugih materialov s polarizirajočo svetlobo.
7. Digitalni mikroskop: Ta vrsta mikroskopa zajema digitalne slike in videoposnetke vzorca, kar omogoča lažjo skupno rabo in analizo.
8. Mikroskop z vrstično sondo: Ta vrsta mikroskopa lahko pregleduje površine s skeniranjem sonde nad vzorcem. Vključuje mikroskope na atomsko silo (AFM) in vrstične tunelske mikroskope (STM).
To je le nekaj primerov različnih vrst mikroskopov, ki so na voljo. Vsaka vrsta ima svoje specifične aplikacije in prednosti, odvisno od področja študija in narave opazovanega vzorca.